Η ιστορία ξεκινά με την επίσκεψη που δέχεται ο Σέβερους Σνέιπ από την Ναρκίσα, μητέρα του Ντράγκο Μαλφόι, και την αδερφή της, Μπέλατριξ Λεστρέιντζ, η οποία του δείχνει ξεκάθαρα ότι δεν τον εμπιστεύται διόλου. Εκεί, ο Σνέιπ ορκίζεται μέσω του Απαραβίαστου Όρκου να προστατέψει τον Ντράκο, καθως αυτός θα προσπαθεί να εκπληρώσει την αποστολή που του ανάθεσε ο Βόλντερμορτ, και να την αποτελειώσει αν ο Ντράκο αποτύχει. Ο Βόλντεμορτ και οι Θανατοφάγοι προκαλούν χάος και πανικό στην Βρετανία, που ακόμα και οι Μαγκλ κατάλαβαν ότι κάτι συμβαίνει.
Ο Χάρι επιστρέφει στο σπίτι των θείων του και δέχεται την επίσκεψη του Ντάμπλντορ. Του αναφέρει ότι ο νονός του στην διαθήκη του αφήνει τον Χάρι ως τον μόνο κληρονόμο. Αυτό αποδεικνύεται όταν καλούν το σπιτικό ξωτικό του σπιτιού του Σείριου, το οποίο αναγκάζεται να ακολουθεί μόνο τις εντολές του ιδιοκτήτη του. Κάτι που έγινε. Ο Χάρι, μετά από αυτό, ακολούθησε τον Ντάμπλντορ, ο οποίος με την βοήθεια του νεαρού κατάφερε να πείσει τον συνταξιοδοτημένο πλεον καθηγητή Οράτιο Σλάγκχορν να επιστρέψει στη παλιά του θέση στο Χόγκουαρτς – η οποία όπως υποθέτει ο Χάρι είναι η άμυνα κατά των σκοτεινών δυνάμεων. Ο Χάρι περνάει τις υπόλοιπες διακοπές του στο Μπάροου μαζί με τον Ρον και την Ερμιόνη και μαθαίνει ότι ο Μπιλ Ουέσλι έχει αρραβωνιαστεί την Φλερ Ντελακούρ, προς μεγάλη απογοήτευση των γυναικών της οικογένειας, ενώ ο Χάρι αρχίζει να αναπτύσσει ερωτικά συναισθήματα για τη Τζίνι.
Οι τρεις φίλοι λαμβάνουν τα αποτελέσματα των ΚΔΜ και οι βαθμοί του Χάρι και του Ρον στα φίλτρα είναι χαμηλοί για να ΕΔΕΜ τάξη του Σνέιπ, με αποτέλεσμα να ξεχάσουν την καριέρα τους ως χρυσούχοι (αφού είναι απαραίτητο μάθημα γι’αυτό). Αφού έχουν προμηθευτεί όσα χρειάζονται από την Διαγώνιο Αλέα, φτάνει η μέρα που επιστρέφουν στο Χόγκουαρτς. Εκεί, θα μάθουν ότι ο Σλάγκχορν είναι τελικά καθηγητής φίλτρων και ο Σνέιπ αναλαμβάνει την διδασκαλία της άμυνας, που πάντα ήθελε. Έτσι, ο καινούργιος καθηγητής των φίλτρων δέχεται τον Χάρι και τον Ρον ακόμα και με χαμηλότερο βαθμό, αλλά δεν έχουν προμηθευτεί όσα χρειάζονται για το μάθημα. Ο καθηγητής τους λέει ότι μπορούν να χρησιμοποιήσουν τα βιβλία που έχει στην βιβλιοθήκη της τάξης μέχρι να έρθουν τα δικά τους. Το βιβλίο που παίρνει ο Χάρι ανήκει στον ημίαιμο πρίγκιψ, ο οποίος με τις σημειώσεις που έχει στο βιβλίο, αποδεικνύεται ιδιοφυΐα στο μάθημα και αποφασίζει να παραποιήσει λίγο το βιβλίο, ώστε να φαίνεται σαν καινούργιο.
Ο Χάρι, την ίδια στιγμή, είναι αρχηγός της ομάδας κουίντιτς και πρέπει να κάνει δοκιμαστικά ενόψει του νέου πρωταθλήματος. Ο Ντάμπλντορ ανέλαβε να του κάνει κάποια «μαθήματα» σχετικά με τον Βόλντεμορτ, για να τον προετοιμάσει. Στην ουσία βλέπουν αναμνήσεις του διευθυντή της σχολής που έχουν σχέση με τον Βόλντεμορτ. Λίγο πριν το τέλος της χρονιάς του, βλέπουν μια ανάμνηση του Σλάγκχορν, η οποία όμως είναι παραποιημένη. Γι’αυτό, ζητά από τον Χάρι να προσεγγίσει τον καθηγητή και να πάρει την αληθινή ανάμνηση. Όταν αυτό γίνεται διαπιστώνουν ότι ο καθηγητής είχε καναφέρει να διευκολύνει τον άλλωτε μαθητή του Τομ Ριντλ να καταλάβει πώς λειτουργούν οι Πεμπτουσιωτές. Ο διευθυντής του Χόγκουαρτς του λέει ότι είναι πολύ κοντά στο να βρει τον πρώτο Πεμπτουσιωτή και του υπόσχεται ότι, όταν τον βρει, θα τον πάρει μαζί του.
Καθ’όλη την διάρκεια της χρονιάς, ο Χάρι αναφέρει την ύποπτη συμπεριφορά του Μαλφόι σε έναν φαινομενικά αδιάφορο Ντάμπλντορ, ο οποίος όμως ζητάει από τον Σνέιπ να αρχίσει τις έρευνες. Μετά από λίγο καιρό ο Χάρι μαθαίνει από την Καθηγήτρια Τρελόνι ότι ο Σνέιπ ήταν αυτός που αποκάλυψε το περιεχόμενο της Προφητείας στον Βολντερμορτ, το οποίο τελικά οδήγησε στους θανάτους του Τζέιμς και της Λίλη Ποτερ. Εξαγριωμένος, ο Χάρι ζητάει εξηγήσεις από τον Ντάμπλντορ, ο οποίος όμως διαβεβαιώνει για την καλή πίστη του Σνέιπ.
Ο Ντάμπλντορ έχει ανακαλύψει το μέρος όπου πιθανώς να βρίσκεται ένας Πεμπτουσιωτής και ζητά από τον Χάρι να τον συνοδεύσει να τον εξουδετερώσουν. Συνεχίζοντας να μην εμπιστεύεται τον Μαλφοι και τον Σνειπ, ο Χάρι λέει στον Ρον, την Ερμιόνη, τη Λούνα, τον Νεβιλ και την Τζίνη να παρακολουθούν τις κινήσεις τους ενώ αυτος θα φύγει με τον Νταμπλντορ. Ο Χάρι και ο Νταμπλντορ διακτινίζονται σε μία απόμακρη σπηλιά, και βρίσκουν τον Πεμπτουσιωτή (το μενταγιόν του Σλίθεριν), αλλά ο Νταμπλντορ δηλητηριάζεται αφου πίνει από το φίλτρο που κάλυπτε το μενταγιόν στην κρυψώνα του.
Γυρνώντας στο Χόγκσμιντ, ο Χάρι και ο Ντάμπλντορ βλέπουν το Σημάδι του Βόλντεμορτ,το Σκοτεινό Σήμα, να βρίσκεται πάνω από το Χόγκουαρτς. Αμέσως πετούν προς τον Πύργο της Αστρονομίας και βρίσκονται αντιμέτωποι με τον Ντράκο Μαλφόι. Ο Νταμπλντορ προλαβαίνει να ακινητοποιήσει το Χαρι, ο οποίος είναι κρυμμένος κατω από τον Αόρατο Μανδύα του, ακριβώς πριν ο Ντράκο αφοπλίσει τον Νταμπλντορ. Ο Ντράκο παραδέχεται ότι αυτός ευθύνοταν για όλες τις επιθέσεις που συνέβησαν στο σχολείο, και ότι έχει επιτυχώς καταφέρει να οδηγήσει τους Θανατοφάγους να εισβάλλουν στο Χόγκουαρτς, παρ'ολο που ο Ντάμπλντορ πιστεύει ότι το φοβισμένο αγόρι δρα απειλούμενο από το Βόλντεμορτ.
Καθώς τα μέλη του Τάγματος του Φοίνικα, οι καθηγητές και οι μαθητές πολεμούν τους οπαδούς του Βόλντεμορτ μέσα στο κάστρο, κάποιοι Θανατοφάγοι ξεφεύγουν και εμφανίζονται στο πύργο και παρακινούν το Ντρακο να ολοκληρώσει τη αποστολή του - να σκοτώσει τον Νταμπλντορ - αλλα ο Ντράκο διστάζει. Εκείνη τη στιγμή καταφθάνει ο Σνέιπ και ο εξαντλημένος Νταμπλντορ τον παρακαλεί. Ο Σνέιπ σκοτώνει τον Νταμπλντορ με την Αβάντα Κεντάβρα, και το πτώμα του πετιέται πανω από το Πύργο της Αστρονομίας. Με το θάνατο του Ντάμπλντορ ο Χάρι απελευθερώνεται από το ξόρκι που τον ακινητοποίησε, και αμέσως αρχίζει να καταδιώκει τον Σνέιπ, ο οποίος αποκαλύπτει στον Χάρι ότι αυτός είναι ο Ημιαιμος Πρίγκηψ ενώ μονομαχούν, και παραδώξως τον συμβουλεύει πως να μονομαχεί σωστά. Ο Σνέιπ ξεφεύγει με τον Μαλφόι, και ο Χάρι ανακαλύπτοντας το πτώμα του Νταμπλντορ παίρνει από τη τσέπη του το μενταγιόν του Σλίθεριν, συνειδητοποιώντας ότι είναι πλαστό. Μέσα στο μενταγιόν βρίσκει ένα σημείωμα από κάποιον με τα αρχικά Ρ.Α.Μπ, που έχει κλέψει τον αληθινό Πεμπτουσιωτή.
Η σχολική χρονιά τελειώνει απότομα με την κηδεία του Νταμπλντορ. Η Καθηγήτρια ΜακΓκόναγκαλ τοποθετείται στη διεύθυνση του Σχολείου και ο Καθηγητής Σλάγκχορν αντικαθιστά τον Σνέιπ ως υπεύθυνος του κοιτώνα του Σλίθεριν, αν και υπονοείται ότι το Χογκουαρτς ενδέχεται να μην ξανανοίξει. Ο Χάρι αποφασίζει να παρατήσει το σχολείο για να αναζητήσει τους υπόλοιπους Πεμπτουσιωτές. Ο Ρον και η Ερμιόνη υπόσχονται να τον ακολουθήσουν, ενώ ο Χάρι τελειώνει παρά τη θέληση του τη σχέση του με τη Τζίνι για να τη προστατεύσει από το Βολντεμορτ.
Είναι το έκτο βιβλίο της σειράς με πρωταγωνιστή τον Χάρι Πότερ από την Τζ. Κ. Ρόουλινγκ. Στα ελληνικά, την μετάφραση κάνει η Καίτη Οικονόμου και κυκλοφόρησε τον Νοέμβριο του 2005 από τις εκδόσεις Ψυχογιός. Ένα βιβλίο γεμάτο ανατροπές, με το τέλος να αφήνει μια πικρία στους αναγνώστες, αφού ο Σνέιπ παρουσιάζεται ως διπρόσωπος, που κατάφερε να ξεγελάσει τον κορυφαίο μάγο όλων των εποχών (τον Ντάμπλντορ).
Έχει κυκλοφορήσει και σε ταινία, με πρωταγωνιστές του Ντάνιελ Ράντκλιφ, Ρούπερτ Γκριν και Έμμα Γουάτσον.
Comments